Прибайкальский национальный парк был организован в 1986 г., в год наивысшего накала борьбы общественности за сохранение оз. Байкал. Территория парка виде узкой полосы охватывает большую часть (около 470 км) западного побережья озера - от п. Култук на юге до мыса Кочериковского на севере, а также остров Ольхон. Общая площадь - 417297 га. Из них 305000 га - земли лесного фонда, остальная площадь приходится на земли сельскохозяйственного назначения (в основном - реликтовые байкальские степи). Территория национального парка разделена на 5 функциональных зон. Это: заповедная зона, площадь 86514 га; зона рекреации и познавательного туризма, 171108 га; зона обслуживания посетителей, 13791 га; зона традиционного экстенсивного природопользования, 33884 га; зона хозяйственного назначения, включающая сельскохозяйственные земли, вошедшие в национальный парк без изъятия из хозяйственного использования, их площадь - 112000 га. Вместе с 4 другими федеральными ООПТ, находящимися в Байкальской котловине, Природный национальный парк входит в состав участка Всемирного Природного наследия ЮНЕСКО "Озеро Байкал", сохраняя самый значительный по протяженности участок байкальских берегов.
Охраняемая территория включает восточные склоны и (местами) водораздел Приморского хребта с абсолютными высотами от 1100 м на юге до 1500 м на севере. Южная часть хребта рассечена вытекающей из Байкала могучей рекой Ангарой. В пределах национального парка в озеро Байкал впадают сравнительно крупные реки - Голоустная, Бугульдейка, Анга, Сарма. Ландшафт ПНП очень разнообразен и живописен. На байкальских берегах много величественных утесов и скал, живописных заливов и бухт. Есть пещеры, самые крупные из них: Ая (протяженность 570 м), "Мечта" (250 м). Очень красивы скалистые мысы побережий Малого Моря (пролива, отделяющего остров Ольхон от западного берега).
Наиболее известные среди них - священные для байкальских бурят Бурхан и Хобой (остров Ольхон). Множество любителей пляжного отдыха ежегодно отдыхает на прогреваемых летним солнцем заливах и бухтах южной части Малого Моря, "туристической Меккой" считается Бухта Песчаная, расположенная севернее с. Бол. Голоустное. Своеобразен и красив степной ландшафт в средней части побережья Байкала и на о. Ольхон. Невысокие каменистые хребты, скальные останцы, котловины с солеными озерами несут загадочное очарование древней природы Центральной Азии.
На территории национального парка хорошо выражены все характерные для Сибири высотные пояса растительности: горные тундры и альпийские луга, подгольцовые стланики и редколесья, темнохвойные и светлохвойные леса, степи. Прибайкальский национальный парк играет исключительно важную роль в сохранении биоразнообразия Байкала и Прибайкалья, заметно превосходя по разнообразию растительного и животного мира, особенно - редких видов, любую другую байкальскую ООПТ. В частности флора сосудистых растений парка насчитывает 1385 видов, из них 100 включены в Красную книгу Иркутской области, 16 - в Красную книгу РФ.
Среди редких растений парка 22 вида - реликты разного возраста. Эндемичных растений в ПНП насчитывается 20 видов. Наибольший интерес представляют узко локализованные эндемики Приольхонья и острова Ольхон.
В реках и озерах национального парка обитает 25 видов рыб. Наибольшую ценность представляют таймень, ленок (оба вида входят в Красную Кингу Иркутской области), черный хариус. Герпетофауна насчитывает 4 вида земноводных (сибирская и остромордая лягушки, монгольская жаба, сибирский углозуб) и 5 - рептилий (живородящая и прыткая ящерицы, гадюка, щитомордник, узорчатый полоз). Из земноводных, наибольшего внимания заслуживает монгольская жаба. В Иркутской области она обитает только в Прибайкальском национальном парке - на Ольхоне и Приольхонье. Из пресмыкающихся нуждаются в особом контроле прыткая ящерица и узорчатый полоз. Все три перечисленные вида включены в Красную книгу Иркутской области.
Фауна млекопитающих насчитывает 63 вида. Высока численность копытных (благородный олень, косуля, кабан, кабарга, лось, северный олень). В национальном парке находятся важные зимовочные местообитания этих животных. Кабан на западном побережье Байкала обитает только в южных лесничествах Прибайкальского национального парка. Богато представлены хищные звери (соболь, колонок, горностай, ласка, степной хорь, норка, барсук, росомаха, выдра, волк, лисица, медведь, рысь).
Тревогу внушает судьба крайне малочисленной изолированной популяция рыси на острове Ольхон (состоит лишь из нескольких особей). В Красную книгу Иркутской области включены 3 вида млекопитающих: ольхонская полевка, степной хорь, выдра. Среди млекопитающих наиболее редкий вид - ольхонская полевка (Alticola olchonensis). Она нуждается в особом внимании. Первоначально она была описана в качестве подвида серебристой полевки, недавно обоснован ее видовой статус. Это единственный эндемичный вид млекопитающих в Иркутской области. Обитает в скальных останцах и в россыпях камней только в пределах реликтовых степей Ольхона и Приольхонья.
Предварительный список птиц национального парка включает более 300 видов, из них 174 - гнездящиеся, 37 - вероятно гнездящиеся, 34 - пролетные, более 50 - залетные, 8 - прилетающие на зимовку. Из них в Красную книгу Международного союза охраны природы включены 11 видов птиц, в Красную книгу птиц России - 15, в Красную книгу Иркутской области - 22. Следует помнить, что все птицы Международной Красной книги входят также и в Красную книгу России, а в региональную Красную Книгу соответственно входят виды и Международной и федеральной Красных книг. Всего в ПНП насчитывается 48 "краснокнижных" видов пернатых. Живой эмблемой ПНП можно считать орла. На территории национального парка встречаются 7 видов орлов и орланов, особую ценность представляет уникальная гнездовая группировка орла-могильника (с 1997 г. Прибайкальский национальный парк осуществляет проект по его изучению и охране). На оз. Байкал этот вид гнездится только в пределах национального парка (лесостепи Приольхонья и о. Ольхон). Является природным прототипом священного "Белоголового Орла", т.е. одного из главных божеств байкальских бурят-шаманистов. По легенде "Царь-Орел" живет именно на Ольхоне - в пещере на мысе Бурхан (наиболее почитаемое бурятами место Байкала, его сакральный центр). В начале 1980-х гг. на Байкале гнездилось 16-19 пар, в 2004 г. - лишь 2 пары. Наиболее вероятная причина катастрофического снижения численности прибайкальской популяции могильника - гибель орлов на зимовке в Китае. Беркут гнездится в большинстве лесничеств ПНП, с наибольшей плотностью - на о. Ольхон (3 пары). Всего в ПНП обитает не менее 10 пар этого орла. Еще в 1970-х гг. крупнейшая на западном берегу Байкала группировка орлана-белохвоста гнездилась на о. Ольхон - 6 пар. Сейчас на Ольхоне гнездится лишь 1 пара.
Еще одна, возможно, в 2001-2002 гг. обитала в ПНП на юго-западном побережье Байкала. С 1996 г. регулярно зимует в истоке р. Ангары (максимальное количество наблюдалось зимой 2003/2004 гг. - 7 особей). Балобан на Байкале гнездится только в пределах Прибайкальского национального парка (Приольхонье, Ольхон). В последние годы численность вида повсеместно сокращается. Основная причина - нелегальный отлов и вывоз из России для продажи соколиным охотникам Ближнего Востока. В 1980-х - 1993 гг. в Приольхонье гнездилось примерно 5-8 пар. В настоящее время - в лучшем случае 1 пара. Браконьерский пресс испытывает на себе и кречет, прилетающий в парк на зимовку. Сотрудники национального парка ведут борьбу с незаконным "соколиным промыслом". Последним районом Иркутской области, где вплоть до 1950-1960-х гг. достоверно гнездилась восточная дрофа, является о. Ольхон. Для 2001-2004 гг. имеются достоверные сведения о встречах, причем, как летних, так и зимних, в Приольхонье. Чучело, изготовленное из крупного самца, подобранного лесниками национального парка еще живым, но сильно истощенным в зимний сезон 2000/ 2001 гг., хранится в Музее природы г. Иркутска. Черный аист вероятно гнездящийся вид большинства лесничеств национального парка. Через национальный парк (юго-западное побережье Байкала в районе Кругобайкальской железной дороги) проходит трасса осеннего пролета черного аиста. В сентябре здесь можно наблюдать до 10 аистов в день. Огарь гнездится по всему побережью. Группировка, населяющая Приольхонье и о. Ольхон (а также мелкие острова Малого Моря) является крупнейшей в Иркутской области. Ее примерная численность - 120-140 пар. Отдельные пары гнездятся по всему побережью национального парка, предпочитая скалистые мысы. Бородатая куропатка на Байкале обитает только в национальном парке. Гнездящаяся в Приольхонье и на Ольхоне группировка является крупнейшей в Иркутской области и поэтому заслуживает особой охраны.
Особую ценность представляют находящиеся в пределах Прибайкальского национального парка 3 ключевые орнитологические территории (КОТ) международного значения - "Остров Ольхон и Приольхонье", "Южно-Байкальский миграционный коридор соколообразных", "Исток и верхнее течение р. Ангара". Большинство редких видов пернатых парка гнездится именно в пределах первого из названных КОТ. Незамерзающая полынья в истоке р. Ангары представляет собой самую крупную в Восточной Сибири "холодную" зимовку водоплавающих птиц. Здесь переживают зиму до 10 тысяч уток (численно преобладает гоголь). Юго-западное побережье Байкала является "трассой" массового осеннего пролета хищных птиц. В день здесь их пролетает до 2 тысяч экземпляров, для Сибири это явление исключительное. Любители птиц могут наблюдать здесь миграцию многих редких "краснокнижных" видов пернатых хищников, а также черного аиста, интересных воробьиных птиц (сибирский горный вьюрок, лапландский подорожник и др.).
Птицы: аист чёрный, балобан, беркут, веретенник бекасовидный азиатский, дрофа, журавль чёрный, клоктун, красавка, кроншнеп дальневосточный, могильник, орёл степной, орёл-карлик, орлан-белохвост, орлан-долгохвост, подорлик большой, скопа, сокол сапсан, филин, фламинго розовый
Млекопитающие: бурозубка, бурозубка бурая, бурозубка крошечная, кабарга, кожан двухцветный, медведь бурый, нерпа байкальская, олень благородный, олень северный, росомаха, рысь
Рыбы костные: ленок, таймень
Пресмыкающиеся или рептилии: гадюка, полоз узорчатый, щитомордник, ящерица живородящая
Земноводные: жаба монгольская, лягушка остромордая, лягушка сибирская, углозуб сибирский