Южно-Уральский заповедник расположен в Белорецком районе Республики Башкортостан. Включает самый высокогорный район Южного Урала с горными темнохвойными, сосновыми и широколиственными лесам, субальпийскими лугами, каменистыми россыпями. Организован в октябре 1978 г. Общая площадь 255 тыс. га. Часть территории (24,5 тыс. га) расположена в пределах Челябинской области.
Основное направление деятельности - охрана и комплексное изучение богатейшего по флоро-фаунистическому составу природного комплекса Южного Урала, изучение восстановительных процессов в горных темнохвойных лесах, сохранение и изучение башкирской бортевой пчелы и бортевого пчеловодства в пределах заповедной и примыкающей территории.
ЮУЗ расположен в гористой области, где происходит наиболее частый обмен воздушных масс умеренных и субтропических широт с арктическими. Территория ЮУЗ характеризуется резко континентальным климатом. Зимой здесь господствует воздух азиатского антициклона. Зима холодная, продолжительная, лето теплое, иногда жаркое. Безморозный период составляет 80-120 дней, местами сокращаясь до 60 дней. В отдельные годы в понижениях рельефа заморозки могут быть во все месяцы лета.
ЮУЗ представляет собой гигантский аккумулятор воды для ряда регионов. Здесь берет начало множество рек и речушек - притоки реки Белой: Тюльма, Большой и Малый Катав, Большой и Малый Инзер, Юрюзань, Байгаза, Капкалка, Хакат-каза, Кургуза, Кушьелга, Багрышта, Кайлыш, Кузьелга, Реветь и др. Интенсивные рубки горных лесов в 70-х годах ( до организации ЮУЗ) привели к их истощению и оскудению, что способствовало обмелению рек. Долины рек, как правило, узки и ассиметричны. Глубина рек незначительна: в самых глубоких местах она не превышает 1-2 м. Одна из основных водных артерий - Тюльма - отличается исключительной чистотой воды. После установления заповедного режима в ней поселились бобры, вновь вернулась выдра, стала нереститься красная щука - таймень, возросла численность хариуса, форели, включенных в Красную книгу Башкортостана.
Настоящими хранителями воды являются болотистые ландшафты ЮУЗ. Хотя по материалам лесоустройства площади, занятые болотами составляют всего 126 га, в действительности болотистых мест гораздо больше. Самое большое болото - "Сычинское" - имеет площадь 750 га. Находящиеся рядом болота "Моховое" и "Колпацкие" имеют меньшую площадь. Это очень примечательные " висячие" болота. Вода в них находится в медленном движении. Сток воды замедляется обильно растущими здесь мхами, осоками и кустарниками (преимущественно видов ивы). Эти болота питаются влагой непосредственно из атмосферы, но в их питании громадную роль играет и влага, конденсируемая громадными каменистыми россыпями, площадь которых составляет здесь 13 тыс. га.
Территория ЮУЗ расположена на западном макросклоне Башкирской части Урал-тау в виде двух горных цепей, которые ориентированы с северо-востока на юго-запад. В первую группу входят хребты Белягуш, Нары, Зигальга высотой до 1000 м над у.м. Восточнее их размещается вторая большая группа хребтов и гор высотой до 1600 м над у.м. и более: Бакты, Машак, Большой Ямантау. Высочайшая вершина последней поднимается на 1646 м над у. м. Вершины этих склонов во многих местах покрыты мощными каменистыми россыпями, которые образованы в периоды наибольшего похолодания ледниковых эпох под действием низких температур. Основными почвами ЮУЗ являются горно-лесные серые. В наиболее приподнятой его части распространены горно-тундровые, горно-луговые почвы, которые ниже сменяются горно-лесными бурыми и горно-дерново-подзолистыми, сменяющимися, в свою очередь, горно-лесными серыми. На пониженных элементах рельефа и под степями формируются черноземы. Совместное влияние рельефа и почвообразующих пород на почвообразовательный процесс находит свое отражение в примитивных и малоразвитых почвах.
Основное богатство ЮУЗ - горные леса, играющие роль естественного буфера, преграждающего путь сухим юго-восточным ветрам. Заповедный лес на 34% состоит из березы, 20% - осины, 17% - ели, 16% - пихты, 8% - сосны, 3% - липы. Основными лесообразующими породами в темнохвойных лесах являются пихта (Abies sibirica) и сибирская ель (Picea obovata), в светлохвойных - сосна обыкновенная (Pinus sylvestris) и лиственница Сукачева (Larix sukaczewii). Рукотворные леса (лесные культуры) созданы на площади около 5 тыс. га и занимают около 2% лесопокрытой площади. В лесах растут различные кустарники, в том числе занесенные в Красную книгу республики: можжевельник обыкновенный (Juniperus communis), волчье лыко (Daphne mezereum), курильский чай кустарниковый (Pentaphylloides fruticosa) и др. Большим числом видов представлен род ива (Salix). Учитывая исключительно высокое водоохранно-почвозащитное значение горных лесов, принято решение о целесообразности перевода их в 1 группу лесов и изъятия их из хозяйственного пользования. Травянистая флора заповедника насчитывает более 1000 видов, среди которых множество редких реликтовых, эндемичных и ценных в хозяйственном отношении видов.
Из представителей фауны в заповеднике встречаются все крупные млекопитающие, отмеченные в Башкортостане. Вблизи водоемов с древнейших времен сохранилась выдра. Можно встретить колонии бобров. Прижилась здесь и завезенная в республику в 30-е годы американская норка. Сохранился ценный пушной зверь - куница.
Богата авифауна заповедника. С высотой видовое обилие и численность сокращается. В весенне-летний сезон здесь можно встретить ряд видов земноводных (жабу, лягушку травяную) и пресмыкающихся (водяного ужа, медянку обыкновенную, веретеницу ломкую), занесенных в Красную книгу Башкортостана. Сохранилась в ЮУЗ и знаменитая башкирская бортевая пчела. Составной частью природного комплекса заповедника являются насекомые, среди которых много вредителей. Выявлено 24 вида дендрофильных насекомых (главным образом усачи), обнаружен 21 вид жужелиц. Зоологические исследования в заповеднике напрвлены на обогащение местной фауны ценными охотничье-промысловыми видами животных.
Млекопитающие: бобр, куница, норка европейская
Пресмыкающиеся или рептилии: веретеница, медянка, уж водяной