В 1892 году на территории древнего города был основан археологический музей, превратившийся в наши дни в крупное научное и культурное учреждение - Национальный заповедник "Херсонес Таврический".
Общая площадь заповедника составляет около 500 гектаров. Основой заповедника является сложного профиля музей, экспозиция которого объединяет в себе три современных типа музея: археологический, исторический и типологический. Музейная экспозиция в двух зданиях соответствует двум историческим эпохам: античной и средневековой.
Самостоятельными экспозициями под открытым небом являются собственно городище Херсонеса, средневековые крепости Каламита и Чембало. Музейное собрание насчитывает более 200 тысяч экспонатов, многие из которых являются уникальными.
В соответствии с задачами, стоящими ныне перед коллективом по выявлению, сохранению и популяризации археологических памятников, в заповеднике сейчас действуют отделы античной и средневековой истории, архитектурно-археологический, научно-просветительный, охраны и исследования памятников, фондового хранения, научной реставрации. Кроме того, в заповеднике имеются архив и библиотека.
Все отделы укомплектованы высококвалифицированными специалистами, подлинными энтузиастами своего дела. В коллективе трудятся 6 кандидатов исторических наук, еще 10 сотрудников готовятся к защите диссертаций. Генеральный директор заповедника - Леонид Васильевич Марченко помимо степени кандидата исторических наук имеет звание заслуженного работника культуры Украины.
Уникальность памятников Херсонеса и наличие подготовленных кадров сделали заповедник базой практики учащихся и студентов. Только в сезоне 2000 года в Херсонесе прошли практику киевские и харьковские, московские и санкт-петербургские школьники, студенты ведущих вузов Украины и России, в том числе Московского, Киевского, Санкт-Петербургского и Харьковского университетов, Киево-Могилянской Академии.
В последние годы значительно возрос интерес к Херсонесу со стороны специалистов зарубежных стран. Материалы о нем все чаще появляются на страницах зарубежной прессы, доклады о херсонесских исследованиях становятся темой обсуждения на международных конференциях. На территории заповедника работают совместные с иностранными коллегами археологические экспедиции: Института классической археологии Техасского университета под руководством профессора Джозефа Картера, Варшавского университета во главе с профессором Тадеушем Сарновским и университета польского города Познани (профессор Анджей Бернадский). При содействии американских специалистов Херсонес включен в число 100 памятников мира, сохранение которых курирует Мировой Фонд памятников.
Один из руководителей совместной экспедиции - Джозеф Картер - предложил организовать на базе заповедника Национальный археологический парк, привлекая некоммерческие зарубежные фонды. С реализацией этого грандиозного и многообещающего проекта заповедник связывает свое вступление в третье тысячелетие.